Liên hệ
Tiếng Việt
Tiếng Anh
Thứ bảy, 12/07/2025
Optimization-based Molecular Dynamics Studies of SARS- CoV-2 Molecular Structures Research on COVID- 19
Cập nhật vào: Chủ nhật - 24/11/2024 21:53
Nhan đề chính: Optimization-based Molecular Dynamics Studies of SARS- CoV-2 Molecular Structures
Research on COVID- 19
Nhan đề dịch: Nghiên cứu động lực học phân tử dựa trên tối ưu hóa của cấu trúc phân tử SARS-CoV-2
Nghiên cứu về COVID-19
Tác giả: Jiapu Zhang
Nhà xuất bản: Springer Cham
Năm xuất bản: 2023
Số trang: 973 tr
Ngôn ngữ: Tiếng Anh
ISBN: 978-3-031-36773-1
SpringerLink
Lời giới thiệu:
Tài liệu đóng vai trò là hướng dẫn toàn diện cho các nghiên cứu MD dựa trên tối ưu hóa về cấu trúc phân tử của protein và RNA của SARS-CoV-2. Cuốn sách bắt đầu bằng cách thực hiện tối ưu hóa cục bộ, tính đến chuyển động ba vật thể và tối ưu hóa các liên kết không cộng hóa trị của từng cấu trúc phân tử. Các cấu trúc được tối ưu hóa đạt đến trạng thái chuyển tiếp mang lại độ ổn định tốt nhất và năng lượng thấp nhất. Quá trình tối ưu hóa sử dụng chiến lược kết hợp tối ưu hóa toán học với nhiều thuật toán tìm kiếm cục bộ khác nhau. Cách tiếp cận này làm giảm đáng kể khối lượng dữ liệu đồng thời loại bỏ dữ liệu tin sinh học không liên quan. Cuốn sách này đặc biệt có giá trị đối với các chuyên gia làm việc trong các lĩnh vực tính toán thực tế , hóa sinh tính toán, vật lý sinh học tính toán, tối ưu hóa và động lực học phân tử, tin sinh học cấu trúc, toán học sinh học và các lĩnh vực liên quan. Nó đóng vai trò là phần giới thiệu cơ bản về các ngành này và cũng là nguồn tư liệu giảng dạy tuyệt vời cho sinh viên.
Từ khóa: Phân tử; Sinh hóa; COVID; Vius
Nội dung cuốn sách gồm những phần sau:
- Enzyme protease giống papain (PLpro)
- Protease giống 3C (3CLpro)
- RNA polymerase phụ thuộc RNA (RdRp)
- RNA Helicase
- Liên kết RNA Helicase với RdRp, NSP7, NSP8a, NSP8b, pRNA, tRNA, ADP-Mg2+ và ATP-Mg2+
- Liên kết Helicase RNA với ADP-Mg2+ , ATP-Mg2+ , và RNA
Spike (S) Glycoprotein
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein D614G
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein N501Y
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein N165A và N234A
- Bệnh SARS (SARS-CoV-1)
- MERS-Virus Corona (MERS)
- ACE2 của con người, IL6 của con người, IL6R của con người và nAChR của con người
- Liên kết PLpro với 12 hợp chất
- Liên kết 3CLpro với N3/Lopinavir/Ritonavir
- Liên kết Dimer 3CLpro với 7 chất ức chế HIV và các chất khác
Spike RBDs liên kết với 50 loại thuốc
- Liên kết Ectodomain ACE2 của con người với 78 loại thuốc
- Liên kết Spike-and-ACE2 với 100 loại thuốc
- Protein bao bọc (E-Protein)
- Glycoprotein màng (M-Protein)
- Nucleocapsid Phosphoprotein (N-Protein)
- Bộ gen RNA của SARS-CoV-2
- NSP7, NSP8, NSP9, NSP10, NSP16 và NSP14
- NSP15
- Những dị nhân khác
- Vắc-xin và thuốc
- Mô hình toán học về đại dịch, dịch tễ học và nguồn gốc của vi-rút
Research on COVID- 19
Nhan đề dịch: Nghiên cứu động lực học phân tử dựa trên tối ưu hóa của cấu trúc phân tử SARS-CoV-2
Nghiên cứu về COVID-19
Tác giả: Jiapu Zhang
Nhà xuất bản: Springer Cham
Năm xuất bản: 2023
Số trang: 973 tr
Ngôn ngữ: Tiếng Anh
ISBN: 978-3-031-36773-1
SpringerLink
Lời giới thiệu:
Tài liệu đóng vai trò là hướng dẫn toàn diện cho các nghiên cứu MD dựa trên tối ưu hóa về cấu trúc phân tử của protein và RNA của SARS-CoV-2. Cuốn sách bắt đầu bằng cách thực hiện tối ưu hóa cục bộ, tính đến chuyển động ba vật thể và tối ưu hóa các liên kết không cộng hóa trị của từng cấu trúc phân tử. Các cấu trúc được tối ưu hóa đạt đến trạng thái chuyển tiếp mang lại độ ổn định tốt nhất và năng lượng thấp nhất. Quá trình tối ưu hóa sử dụng chiến lược kết hợp tối ưu hóa toán học với nhiều thuật toán tìm kiếm cục bộ khác nhau. Cách tiếp cận này làm giảm đáng kể khối lượng dữ liệu đồng thời loại bỏ dữ liệu tin sinh học không liên quan. Cuốn sách này đặc biệt có giá trị đối với các chuyên gia làm việc trong các lĩnh vực tính toán thực tế , hóa sinh tính toán, vật lý sinh học tính toán, tối ưu hóa và động lực học phân tử, tin sinh học cấu trúc, toán học sinh học và các lĩnh vực liên quan. Nó đóng vai trò là phần giới thiệu cơ bản về các ngành này và cũng là nguồn tư liệu giảng dạy tuyệt vời cho sinh viên.
Từ khóa: Phân tử; Sinh hóa; COVID; Vius
Nội dung cuốn sách gồm những phần sau:
- Enzyme protease giống papain (PLpro)
- Protease giống 3C (3CLpro)
- RNA polymerase phụ thuộc RNA (RdRp)
- RNA Helicase
- Liên kết RNA Helicase với RdRp, NSP7, NSP8a, NSP8b, pRNA, tRNA, ADP-Mg2+ và ATP-Mg2+
- Liên kết Helicase RNA với ADP-Mg2+ , ATP-Mg2+ , và RNA
Spike (S) Glycoprotein
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein D614G
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein N501Y
- Đột biến Spike (S) Glycoprotein N165A và N234A
- Bệnh SARS (SARS-CoV-1)
- MERS-Virus Corona (MERS)
- ACE2 của con người, IL6 của con người, IL6R của con người và nAChR của con người
- Liên kết PLpro với 12 hợp chất
- Liên kết 3CLpro với N3/Lopinavir/Ritonavir
- Liên kết Dimer 3CLpro với 7 chất ức chế HIV và các chất khác
Spike RBDs liên kết với 50 loại thuốc
- Liên kết Ectodomain ACE2 của con người với 78 loại thuốc
- Liên kết Spike-and-ACE2 với 100 loại thuốc
- Protein bao bọc (E-Protein)
- Glycoprotein màng (M-Protein)
- Nucleocapsid Phosphoprotein (N-Protein)
- Bộ gen RNA của SARS-CoV-2
- NSP7, NSP8, NSP9, NSP10, NSP16 và NSP14
- NSP15
- Những dị nhân khác
- Vắc-xin và thuốc
- Mô hình toán học về đại dịch, dịch tễ học và nguồn gốc của vi-rút
